Rekonstrukcja (nowych map i obrazów)
Visual Studio Code + wtyczki: NiiVue, Remote Development,
Neurodesk - polecenie “module load” na Calcusie oraz wersja standalone NeurodeskApp
Freesurfer - instalacja freeview standalone (todo)
FSL - instalacja fsleyes standalone (todo)
**https://github.com/nencki-lobi/NAWA - repozytorium skryptów Pawła Jakuszyka https://github.com/nencki-lobi/NAWA/blob/master/General/Analysis.md - szczegółowy opis**
https://www.neurodesk.org/tutorials-examples/ - instrukcje do Neurodesk
https://neuroimaging-core-docs.readthedocs.io/en/latest/index.html - wiki University of Arizona; instrukcje jak postępować z lesion mask w FSL, SPM
https://andysbrainbook.readthedocs.io/en/latest/index.html - Andy bardzo przystępnie tłumaczy różne sposoby analizy. Bestseller, gdyby zostało wydane.
https://bkossows.notion.site/IT-services-e7a02f54f4a6432d8f32f9d8cf8770c5 - opis sposobu konwersji danych z DICOM do NIFTI za pomocą dcm2bids