Data conversion

1. Sprawdzenie lokalizacji i objętości zmian w wokselu

https://github.com/nencki-lobi/MJRIS/blob/main/svs_segment.sh

for s in sub*; do
    find "$s" -type f -iname *svs.nii.gz -size +20M -exec ./code/svs_segment.sh ./${s}/ses-01/anat/${s}_ses-01_FLAIR.nii.gz ./{} ./${s}/ses-01/anat/${s}_ses-01_desc-mask_FLAIR.nii.gz ./derivartives/spectroscopy/${s}/ \\;
done

1. Referencja do wody → zrobić svs_segment i sprawdzić skalowanie po wlaściwej korekcji → CSF: 0.00, GM: 0.14, WM: 0.85. → wconc 33618,25225 → stężenie NAA 6.6 mM (powinno być >10mM) → mail do Jamiego Neara 10.06.2025
2. Sprawdzić rejestrację wokseli przy drugim pomiarze